明清交际时期，准噶尔对清朝确实构成了重大的威胁，但是否是最大的威胁则颇具争议。

准噶尔是一个由蒙古部落组成的政权，其扩张势力开始于明代末年，清朝建立后也一直持续存在。准噶尔曾多次对清朝进行侵犯，如在康熙时期的准噶尔巴图投降的过程中，曾与清朝发生战争。因此，准噶尔的存在对清朝确实带来了威胁。

然而，准噶尔并不是明清交际时期清朝面临的唯一威胁。在明朝末年，李自成的农民起义冲击了明朝的统治。而在明朝灭亡后，李自成的起义军的一部分逃亡至西北地区，与准噶尔形成一定的交互作用。此外，明末辽东地区的杂贼活动也给清朝带来了不小的麻烦。

在准噶尔问题上，历史学界存在不同观点。一些学者认为，准噶尔在明清交际时期的确对清朝构成了最大的威胁。准噶尔曾多次入侵清朝领土，并在明朝灭亡后，成为了辽东地区的统治者，对清朝南方的稳定产生了较大影响。

但也有学者对这一观点持怀疑态度。他们认为，准噶尔在明清交际时期虽然具有一定威胁，但并非最大的威胁。相比之下，清朝内部的政治问题和社会动荡可能对清朝的稳定造成更大的威胁。清朝建立之初，国家经济困难，内部集权力量较强，这些问题才是清朝真正需要应对的挑战。

准噶尔在明清交际时期对清朝确实构成了较大的威胁，但是否是最大的威胁还有待考证。无论如何，面对准噶尔的威胁，清朝采取了一系列的措施，如康熙帝对准噶尔的政策调整和军事行动，这些举措在一定程度上保障了清朝的稳定。